Nei vari livelli saranno sparsi diversi power up in grado di trasformare il personaggio e fornirgli nuove abilità, oltre che aggiungere un punto saluto. Il classico Super Fungo farà crescere Mario, il Fiore di Fuoco gli farà sparare palle di fuoco con i tasti X e Y, mentre la Super Stella lo farà diventare invincibile per 10 secondi. La Foglia Tanooki fornirà il costume da procione, permettendogli di planare con A o B dopo un salto e di colpire i nemici con la coda tramite X o Y, mentre nei mondi speciali si troverà una variante che lo trasformerà in statua con uno schianto a terra. Con il Fiore Boomerang Mario potrà lanciare un boomerang per colpire i nemici da lontano o raccogliere monete, mentre con il Cubo Elica egli potrà volare tenendo premuto A o B. È anche disponibile un rarissimo Cubo, mimetizzato fra i normali Blocchi, che permetterà al protagonista di guadagnare monete extra saltando e muovendosi per un breve periodo di tempo. Non mancherà infine il Fungo 1-up, che donerà una vita extra al giocatore, mentre il Fungo Velenoso che si trova solo nei livelli speciali infliggerà un danno a meno di non essere sotto l'effetto della Super Stella. Per i giocatori meno esperti sono infine disponibili nei mondi dall'1 all'8 alcuni aiuti extra, ovvero la Super Stella di durata maggiore, la foglia Takooni invincibile dopo aver perso 5 vite in un livello, l'Ala-P in caso si perdano 10 vite in un livello e che permette di arrivare alla fine di esso immediatamente.
