Prima di affrontare N, però, viene evocato il pokémon leggendario del gioco (Reshiram o Zekrom), ed è possibile catturarli. Il consiglio è di avere nella propria squadra pokémon con mosse come ipnosi, paralisi e falsofinale che riescono ad indebolirlo a sufficienza. Inoltre, essendo Reshiram o Zekrom al livello 50 non è necessario usare la master ball trovata poco prima. Indebolendolo a sufficienza si possono utilizzare benissimo le Ultra Ball. Reshiram è debole contro attacchi di tipo drago, terra e roccia. Una volta combattuto contro Reshiram o Zekrom, e si spera dopo averli anche catturati, si arriva nella stanza di N e si deve sconfiggerlo per battere definitivamente il Team Plasma.